昌宁县环保局成立于2002年12月，为建设局下设行使行政职能的副科级事业单位。2007年4月分设为县人民政府正科级直属机构，2011年11月政府机构改革时调整为县人民政府工作部门，内设4个股室，核定编制14名。2010年11月县委编办批准成立环境监测站，为环保局下属财政全额拨款股所级事业单位，核定编制10名。2017年5月份县委编办批准成立环境监察执法大队，为县环保局下设副科级公益一类事业单位，核定编制10名。现在编总人数31名，其中公务员11名，工勤人员2名，事业人员18名。设领导职数5名，其中局长1名，副局长3名，事业副科（大队长）1名。